熱心腸研究院

長讀長測序協助發掘腸道菌群中的可移動基因元件

創作:小腸君   審核:小腸君
① PacBio長讀長測序可高效鑑定染色體外可移動基因元件(eMGE),尤其有助於檢測菌群中質粒的種類和豐度。
② 12個糞便的菌群長讀長測序共組裝出82個eMGE基因片段重疊群,其中58種質粒、6種噬菌體及5種不同的腸道病毒crAssphage系首次發現。
③上述質粒大量並廣泛分佈於人體腸道菌群中,新發現的質粒數量比已知腸道菌群質粒多2倍,質粒數量是染色體的3倍。
④擬桿菌門相關質粒的數量最多,耐藥基因主要分佈在低豐度的變形菌門相關質粒上。



資料來源出處: 熱心腸先生