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2022-11-03
Cell子刊:菌群定植如何影響斑馬魚腸道細胞的基因表達?
①存在或不存在微生物組的情況下,分析飼養的斑馬魚幼蟲腸道和相關組織的細胞轉錄組。
②傳統斑馬魚腸上皮具有廣泛的細胞異質性,包括哺乳動物同源細胞類型,如Best4/Otop2、簇細胞等。
③通過比較常規和無菌的圖譜,繪製微生物對每個細胞群轉錄活性的...
2022-11-02
Cell:破解“噁心-嘔吐”反應的腸腦軸神經機制
①開發一個小鼠實驗範式,研究細菌腸毒素如何引起噁心(味覺迴避)和嘔吐(乾嘔)防禦反應。
②鑑定出傳遞毒素相關信號的腸-腦軸神經環路:表達5-羥色胺(5-HT)的腸嗜鉻細胞→表達5-HT受體(Htr3a)的迷走神經元→背迷走神經復合體(DVC)的Ta...
2022-11-01
Nature Reviews:腸道菌群和膽汁酸代謝如何影響人體健康(綜述)
①腸道菌群參與初級膽汁酸(BA)向次級膽汁酸的轉化和腸肝再循環,其組成、豐度和代謝活性受BA的影響。
②抗生素使用等因素引起的菌群失調、體育運動對胃腸蠕動的影響、飲食成分中的膽固醇和纖維等因素都會影響菌群對BA的代謝。
③菌群BA代謝失調與艱難...
2022-11-01
Cell:黏蛋白如何讓腸道安全吸收銅
①通過結構和生化分析發現,腸道黏蛋白MUC2的D1區域中存在2個相鄰的銅結合位點。。
②其中,富含組氨酸的保守位點能結合Cu2+,其可被膳食抗氧化劑(如維生素C)還原為Cu1+。
③還原後的銅(Cu1+)被MUC2中鄰近的富含甲硫氨酸的位點結合。...
2022-10-31
Nature:結直腸癌演化過程中的表型可塑性和遺傳控制
①分析27個結直腸癌(CRC)的297個樣本的空間分辨的配對單腺體基因組、表觀基因組和轉錄組,發現多數基因表達具有高可塑性。
②亞克隆轉錄組變異中僅有低於1%的基因和低於5%的標誌性途徑與遺傳性變化有關。
2022-10-31
Nature:大腸癌基因組與表觀基因組的共同演化
①從30個原發癌和8個伴隨腺瘤中收集1370個樣本,生成1207個染色質可及性譜,527個全基因組和297個全轉錄組。
②染色質修飾基因和復發性體細胞染色質可及性改變中,包括癌症驅動基因調控區域,DNA突變是正向選擇,反之不突變。
③轉錄因子結合...
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